Soruşturmada AC-130 tipi askeri uçaktaki mürettebatın, kliniği, yakınlarda bulunan ve Taliban tarafından ele geçirilmiş olan hükümet binasıyla karıştırdığı sonucuna vardı. 3 Ekim’de Kunduz’un Taliban güçlerinden geri alınması için yürütülen operasyonlar sırasında en az 30 sivil ölmüştü. Sınır Tanımayan Doktorlar Örgütü, saldırıyı savaş suçu olarak tanımlamış ve soruşturma açılmasını istemişti. Örgüt, ABD’nin başta öne sürdüğü saldırı gerekçesini de reddetmişti. Amerikalılar, bölgede kendilerine ateş açıldığı için hastane yakınına saldırıya geçildiğini söylemişler, sonradan hata olduğunu kabul etmişlerdi.
