1974 yılında Kıbrıs Barış Harekatı'na katılan Ekin, uzun süredir diyaliz tedavisi görüyordu.
Mustafa Ekin'in cenazesi, öğle namazına müteakip Selbükü Köy Camii'nde kılınan namazın ardından Selbükü Köy Mezarlığı'na defnedildi. Cenaze törenine Bilecik Valisi Şefik Aygöl, İl Jandarma Komutanı Albay Ferdi Erbakıcı, İl Emniyet Müdürü Beyti Kalaycı ve Aile ve Sosyal Hizmetler Bilecik İl Müdürü İlkay Türkoğlu katıldı. Törene katılan yetkililer, Ekin'in ailesine başsağlığı diledi.