Atlas Tarih Dergisi’nde yer alan bilgilere göre, Fatih Sultan Mehmet İstanbul’a girdiğinde Ayasofya iyi kötü korunmuş durumdaydı. Ancak şimdi Sultan Ahmet Cami’nin olduğu yerdeki Büyük Bizans Sarayı harap halde.
Marmara kıyısındaki Saray da harap vaziyetteymiş. Yani padişahın gelip oturacağı düzgün bir Saray yok.
Fatih'in ilk Saltanat yılları 1460'lara kadar Edirne’dedir. Şehrin imarı için sık sık İstanbul'a gelmiştir.
İstanbul'a bir saray yaptırma kararı veriyor ve yapımı 3-5 sene sürmüştür. Saray bugünkü İstanbul Üniversitesi merkez binasının olduğu yerde yapılıyor.
Osmanlı hanedanı 16 yüzyıl ortalarına kadar bu sarayda kaldı. Kanuni Sultan Süleyman ve torunu 3. Murat Saltanat işleri ile birlikte harem yaşamına da Topkapı Sarayı'na taşıdılar.
Eski saray adını alan bu mekan ölen padişahların eşlerine ve kız çocuklarına tahsis edildiği için de gözyaşı Sarayı olarak anılmıştır. 19 yüzyılın başında çıkan yangında harabeye dönmüştür
Bir sonraki adı Serasker Kapısı. Daha sonra aynı yere Harbiye Nezareti yapılmış ki bugün İstanbul üniversitesidir.
